据国内外公开资料称，国产长身管125毫米滑膛坦克炮，具有与西方同类产品相同的膛压高、初速高、威力大的特点，配有尾翼稳定脱壳穿甲弹、破甲弹和多用途榴弹。但对于坦克炮的威力，各界是众说纷纭。按照日本《PANZER》杂志的说法，该炮在发射穿甲弹时，能在2000米处穿透460毫米厚的均质钢装甲。这个说法明显与国内报道存在很大差异。99式主战坦克的设计和测试人员在接受媒体公开访问的时候，宣称99式坦克主炮的威力能够跟上当前的世界水平。而且根据国外多个防务展览上北方公司所透露的信息看，《PANZER》杂志的这一数值似乎是有意贬低，因为北方公司在10年前就已经在多个防务展览上展出威力达到550毫米的125毫米穿甲弹。就在前几年，北方公司在阿布扎比展出的新型穿甲弹，就能在2000米距离处洞穿600毫米厚的均质钢装甲板。国内的刊物也报道过相同威力的穿甲弹。所以日本人所做的评估可以说是与事实脱节。另外，在数年前的国防科技展览上，曾经展出过国产100毫米反坦克炮上使用的特种穿甲弹，可见我国已经掌握了相关的研制和制造技术。目前，特种穿甲弹在穿甲威力上要比普通的钨合金穿甲弹强约15%。所以笔者相信，99式在发射穿甲弹时，能在2000米处穿透800毫米的均质装甲，而使用特种合金穿甲弹时，同距离穿甲能力达850毫米以上，已经属于世界先进水平。

　　该炮还能发射我国仿制的俄125毫米口径炮射导弹和俄制9M119型炮射导弹，该导弹最大射程5.2公里，最大破甲深度700毫米。炮射导弹的装备极大加强了99式主战坦克的远距离攻击能力。

　　99式主战坦克的辅助武器为一挺炮长操纵的7.62毫米并列机枪和1挺车长操纵的12.7毫米85式高射机枪。

　　火控系统现代战争对战车火控系统提出了更高的要求，进一步提高自动化和智能化程度、缩短火力反应时间、提高首发命中率和远距离打击能力，是世界战车火控系统发展的趋势。99式主战坦克采用的是国产瞄导合一型的“猎-歼”式火控系统，正是为适应这一发展趋势而研制的。根据外国媒体的报道，该系统是国内自行研制的，与MBT-2000自动跟踪式火控系统一样，也是85-IIM的IFCS-212型火控系统的改进型。该系统保留了212型火控系统白昼环境下反应迅速、射击精度高的特点，能有效对付多个目标，具备激光制导、人工指示目标自动跟踪、信息智能化管理等功能，可以在行进问对远距离运动目标进行准确打击。炮长观测、瞄准系统为白光、夜视、测距、制导四合一，配备红外热成像系统，实现全天时、全天候的远距离观察与作战，具备行进间发射制式炮弹和9M119型导弹的功能，有效工作距离5000米以上，并具备打击低空飞行目标的能力。炮手确定目标后按下自动跟踪按钮，系统可自动完成目标跟踪至火炮发射的全过程，提高了系统反应速度和命中精度。99式主战坦克的驾驶员跟96式主战坦克的驾驶员一样，配有多具昼间使用的潜望镜。同样，在夜间驾驶时，99式主战坦克的驾驶员也使用微光夜视仪进行观测，进行夜间驾驶。